核心通識課程模式起源於美國哈佛大學在1978年開始推動的核心課程，核心課程分為數個領域，每個領域中開設相關十數門不同主題的課程，學生在這些課程中選修自己有興趣的課程，即完成對該領域課程的學習。核心課程的優點在於可以融合不同領域的學術內容，讓學生獲得整體性的知識。
為進一步革新提昇清華通識教育，本中心自2000年起推動國內通識教育前所未有之核心通識課程改革，歷經四年 (2001年至2005年) 的規劃與一年試驗，始完成核心通識七向度課程規劃之階段性任務，於2006年正式施行，後多所公私立大專院校跟進，如今已成為台灣高等教育推行通識教育課程的主流作法之一。
對本校而言，核心通識課程的實施，有幾個特色：
(一)核心課程經過精心規劃，率皆為當代學術入門之要，且為跨領域知識。
(二)為求引導學生深入相關知識，從核心課程出發，將通識選修課程以「課群」的概念重新規劃，俾聯繫核心通識與通識選修課程成為有系統的知識體系。
(三)此規劃概念乃因地制宜，因國內大學學分數眾多，難以單科深入相關知識，故以「課群」方式因應增加其深度與廣度。其另具優點如下：
– 體現清華大學通識教育的核心價值，
– 兼顧學科之基本素養與學術之時代意義，
– 核心課程必中選制、維持教師良性競爭與調整彈性，
– 通識選修課程依之調整，提供學生清晰選修方向，
– 加強核心與選修課程之連結，導正通識選修雜漫與必修僵化之弊，
– 合聘教師制度兼顧教學與研究，維繫通識與其他所系之互動。
因此，核心通識課程規劃的長遠意義不僅止於核心通識課而已，其提綱挈領，將進一步引導通識選修部份的轉化。核心通識之規劃亦連結到通識選修課之發展。歷經十年之實施，本中心亦正積極盤整合新課程，拓展文化經典，並加強向度核心課程與選修課群之整合。